Penelitian yang dilakukan di laboratorium Mikrobiologi Pangan ini meliputi aspek mikrobiologi pangan, isolasi, seleksi dan pemeliharaan mikrobia, fermentasi, penanganan limbah secara biologis dan sebagainya. Laboratorium ini memberikan jasa pengujian dna konsultasi di bidang mikrobiologi pangan. PElatihan yang diselenggarakan di laboratorium ini adalah uji mikrobiologi pangan, isolasi dan identifikasi kapang, HACCP, dan parameter limbah industry (BOD, COD, dll).